Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
JupQ02257 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
JupQ02257 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
JupQ02257 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JupQ02257 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JupQ02257 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JupQ02257 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms