Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd1Q01822 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd1Q01822 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms