Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp1Q01514 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp1Q01514 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms