Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EgfrQ01279 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms