Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin2cQ01098 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms