Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms