Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gjb2Q00977 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms