Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms