Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gbp10Q000W5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms