Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1bP97952 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1bP97952 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn1bP97952 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn1bP97952 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn1bP97952 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn1bP97952 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn1bP97952 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn1bP97952 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1bP97952 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1bP97952 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1bP97952 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scn1bP97952 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1bP97952 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1bP97952 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1bP97952 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1bP97952 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1bP97952 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1bP97952 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1bP97952 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1bP97952 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1bP97952 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1bP97952 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1bP97952 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn1bP97952 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn1bP97952 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms