Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlkP97793 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AlkP97793 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AlkP97793 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AlkP97793 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AlkP97793 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AlkP97793 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AlkP97793 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AlkP97793 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AlkP97793 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AlkP97793 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AlkP97793 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AlkP97793 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AlkP97793 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AlkP97793 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AlkP97793 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AlkP97793 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlkP97793 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlkP97793 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlkP97793 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlkP97793 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlkP97793 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlkP97793 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AlkP97793 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlkP97793 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlkP97793 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlkP97793 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlkP97793 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlkP97793 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AlkP97793 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AlkP97793 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AlkP97793 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AlkP97793 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AlkP97793 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AlkP97793 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AlkP97793 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AlkP97793 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AlkP97793 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AlkP97793 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AlkP97793 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AlkP97793 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AlkP97793 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AlkP97793 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AlkP97793 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AlkP97793 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AlkP97793 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AlkP97793 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AlkP97793 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AlkP97793 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AlkP97793 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AlkP97793 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AlkP97793 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AlkP97793 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AlkP97793 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlkP97793 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlkP97793 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlkP97793 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlkP97793 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlkP97793 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlkP97793 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlkP97793 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlkP97793 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AlkP97793 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlkP97793 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlkP97793 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlkP97793 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlkP97793 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlkP97793 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlkP97793 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlkP97793 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlkP97793 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlkP97793 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlkP97793 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AlkP97793 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AlkP97793 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlkP97793 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlkP97793 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlkP97793 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlkP97793 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlkP97793 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlkP97793 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlkP97793 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlkP97793 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlkP97793 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlkP97793 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlkP97793 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlkP97793 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AlkP97793 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AlkP97793 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AlkP97793 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AlkP97793 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AlkP97793 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AlkP97793 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AlkP97793 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AlkP97793 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms