Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms