Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smyd1P97443 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms