Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms