Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RptnP97347 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RptnP97347 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RptnP97347 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RptnP97347 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RptnP97347 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RptnP97347 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RptnP97347 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RptnP97347 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RptnP97347 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RptnP97347 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RptnP97347 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RptnP97347 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RptnP97347 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RptnP97347 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RptnP97347 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RptnP97347 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RptnP97347 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RptnP97347 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RptnP97347 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RptnP97347 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms