Protein–RNA interactions for Protein: P82349

Sgcb, Beta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcbP82349 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SgcbP82349 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgcbP82349 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SgcbP82349 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SgcbP82349 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SgcbP82349 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SgcbP82349 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgcbP82349 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SgcbP82349 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SgcbP82349 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SgcbP82349 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SgcbP82349 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcbP82349 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SgcbP82349 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SgcbP82349 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcbP82349 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgcbP82349 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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