Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgcdP82347 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms