Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms