Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx2P80206 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx2P80206 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx2P80206 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms