Protein–RNA interactions for Protein: P70697

Urod, Uroporphyrinogen decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrodP70697 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UrodP70697 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UrodP70697 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UrodP70697 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UrodP70697 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UrodP70697 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UrodP70697 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UrodP70697 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UrodP70697 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UrodP70697 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UrodP70697 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UrodP70697 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UrodP70697 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UrodP70697 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UrodP70697 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UrodP70697 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UrodP70697 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UrodP70697 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms