Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr4P70658 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr4P70658 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr4P70658 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr4P70658 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr4P70658 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr4P70658 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr4P70658 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms