Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Tp53bp1P70399 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Tp53bp1P70399 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tp53bp1P70399 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tp53bp1P70399 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tp53bp1P70399 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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