Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms