Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfi1P70338 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfi1P70338 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms