Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp7P70280 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms