Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfixP70257 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfixP70257 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfixP70257 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NfixP70257 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfixP70257 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfixP70257 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfixP70257 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfixP70257 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfixP70257 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NfixP70257 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NfixP70257 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfixP70257 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfixP70257 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfixP70257 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfixP70257 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfixP70257 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfixP70257 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfixP70257 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfixP70257 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfixP70257 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NfixP70257 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NfixP70257 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NfixP70257 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NfixP70257 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfixP70257 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfixP70257 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfixP70257 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfixP70257 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfixP70257 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfixP70257 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfixP70257 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfixP70257 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfixP70257 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfixP70257 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfixP70257 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfixP70257 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfixP70257 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfixP70257 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfixP70257 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfixP70257 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfixP70257 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfixP70257 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfixP70257 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfixP70257 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfixP70257 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfixP70257 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfixP70257 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfixP70257 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms