Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf5P70191 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf5P70191 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf5P70191 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms