Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SbdsP70122 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SbdsP70122 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms