Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcbP68404 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcbP68404 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms