Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb4bP68372 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms