Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Acta1P68134 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Acta1P68134 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Acta1P68134 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Acta1P68134 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Acta1P68134 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta1P68134 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Acta1P68134 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Acta1P68134 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta1P68134 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Acta1P68134 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Acta1P68134 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Acta1P68134 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Acta1P68134 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta1P68134 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms