Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2bP67871 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms