Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb3P63080 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms