Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vamp3P63024 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vamp3P63024 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms