Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms