Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rps29P62274 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms