Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms