Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmc5P62196 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmc5P62196 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms