Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphp4P59240 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms