Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms