Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ripk2P58801 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ripk2P58801 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms