Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtnsP57757 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtnsP57757 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtnsP57757 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms