Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NcstnP57716 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NcstnP57716 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NcstnP57716 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NcstnP57716 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms