Protein–RNA interactions for Protein: P57016

Lad1, Ladinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lad1P57016 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lad1P57016 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lad1P57016 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lad1P57016 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lad1P57016 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lad1P57016 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lad1P57016 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lad1P57016 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lad1P57016 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lad1P57016 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lad1P57016 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lad1P57016 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lad1P57016 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lad1P57016 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lad1P57016 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lad1P57016 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lad1P57016 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lad1P57016 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lad1P57016 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lad1P57016 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lad1P57016 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lad1P57016 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms