Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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