Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp1P56716 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rp1P56716 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rp1P56716 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms