Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TdgP56581 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TdgP56581 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TdgP56581 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TdgP56581 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TdgP56581 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TdgP56581 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TdgP56581 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TdgP56581 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TdgP56581 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TdgP56581 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TdgP56581 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TdgP56581 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TdgP56581 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TdgP56581 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TdgP56581 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TdgP56581 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TdgP56581 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TdgP56581 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TdgP56581 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TdgP56581 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms