Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lim2P56563 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lim2P56563 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lim2P56563 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms