Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CckbrP56481 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckbrP56481 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckbrP56481 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckbrP56481 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms