Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AgrpP56473 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AgrpP56473 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms